La institución debe su nombre al barrio Arborizadora Alta y fue fundada en 1988. Posteriormente se fusionó con la sede Pradera Esperanza, construida con el apoyo de los padres de familia. En 2021 inició la reconstrucción de la sede A. En 2023, tras un proceso de diálogo con la comunidad educativa, se acordó nombrar la sede A en honor a Daniel Stiven Duque Buitrago y la sede B a Ivanna Salomé Rangel Molina, en memoria de los menores fallecidos en el atentado del CAI de Arborizadora Alta en abril de 2022. Actualmente, la rectoría está a cargo de Andrés Felipe Marín López.